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千億藍海市場:PROTAC技術熱門靶點全景透視

更新時間:2025-11-11點擊次數:13

一、PROTAC技術概述:從抑制到降解的范式革命

 

傳統的小分子藥物和抗體藥物大多通過“占據驅動"的模式發揮作用,即通過結合在靶蛋白的活性位點上來抑制其功能。這種模式面臨諸多挑戰,如難以靶向無明確活性位點的蛋白、易產生耐藥性等。

 

PROTAC技術開創了一種全新的“事件驅動"模式,其工作機制是一個催化循環過程:

 

  1.  形成三元復合物:PROTAC分子同時結合目標蛋白和E3連接酶,形成一個短暫的POI-PROTAC-E3 Ligase三元復合物。


  2.  泛素化:E3連接酶將泛素鏈轉移到目標蛋白上,將其標記為“待銷毀"。


  3.  降解:被泛素標記的目標蛋白被細胞內的蛋白酶體識別并降解。


  4.  PROTAC循環利用:PROTAC分子本身不被降解,可從復合物中解離,繼續催化下一輪降解循環。

 

這種機制賦予了PROTAC技術高選擇性、高效率和克服耐藥性的獨特優勢,尤其適用于傳統上被認為“不可成藥"的靶點。

 

 二、E3連接酶工具箱:PROTAC的“導航系統"

 

E3連接酶是PROTAC設計的核心,決定了降解的組織特異性、效率和安全性。人類基因組編碼超過600種E3連接酶,但目前PROTAC開發中常用的仍局限于少數幾種。

  RING型 E3連接酶:種類最多,作為支架同時結合靶蛋白和E2泛素結合酶,直接催化泛素轉移。

 

E3連接酶/復合物

特點與功能

PROTAC中的應用

VHL 蛋白

馮·希佩爾-林道蛋白,一個氧感應蛋白復合物的組分。

PROTAC兩大明星"E3之一。與CRBN齊名,廣泛用于PROTAC設計,已有多款招募VHL的PROTAC分子進入臨床試驗。

MDM家族

最重要的p53腫瘤抑制蛋白的負調控因子。

主要用于開發靶向MDM2本身的抗癌藥物。也作為E3配體被用于降解其他蛋白的PROTAC中。

SCF 復合物

由Skp1, Cullin1, F-box蛋白組成。F-box蛋白(如β-TrCP, Skp2)負責底物識別,因此該復合物可降解多種底物。

是早期PROTAC設計的常用招募對象,但由于其復雜性,目前較少用。

APC/C 復合物

“后期促進復合物",控制細胞周期進程,如降解細胞周期蛋白(Cyclins)。

主要在細胞周期中起作用,目前較少用于PROTAC設計。

Cbl 家族

主要負調控受體酪氨酸激酶,如EGFR、PDGFR等。

其配體可用于設計降解特定激酶的PROTAC,是一個有潛力的方向。

TRIM 家族

參與先天免疫、細胞分化等多種過程。

研究熱點,正在探索其配體用于PROTAC,以開發免疫或抗病毒療法。

β-TrCP

識別含有特定磷酸化降解基序的底物,如β-Catenin, IκB。

作為SCF復合物的F-box蛋白,其識別機制被用于設計磷酸化依賴的PROTAC。

Skp2

識別并降解細胞周期抑制蛋白p27等,促進細胞增殖。

是癌癥治療的潛在靶點,也可作為E3配體來源。

IAPs

凋亡抑制蛋白,通過抑制Caspase來阻止細胞凋亡。

其配體(如Bestatin類似物)被用于構建稱為“SNIPERs"或“IAP-based PROTACs"的降解劑。

STUB1/CHIP

與熱休克蛋白協作,清除錯誤折疊的蛋白質。

在降解錯誤折疊蛋白(如與神經退行性疾病相關的蛋白)的PROTAC中具有潛力。

BRCA1-BARD1

BRCA1必須與BARD1形成異源二聚體才具有E3活性,在DNA損傷修復中起關鍵作用。

目前研究更多集中于其本身在癌癥中的作用,在PROTAC中應用較少。

TRAF 家族

TNF受體相關因子,在免疫和炎癥信號通路中起核心作用。

是免疫相關疾病PROTAC開發的潛在E3來源。

 

HECT型 E3連接酶:這類E3連接酶具有一個HECT結構域,其機制是先將泛素從E2“劫持"到自己身上,形成一個E3-泛素中間體,然后再將泛素轉移到底物蛋白上。

 

E3連接酶/家族

特點與功能

在PROTAC中的應用

WWP 家族

包括WWP1, WWP2等,參與調控細胞生長、發育等過程。

其配體正在被探索用于PROTAC設計,以拓展可用的E3類型。

E6-AP

由UBE3A基因編碼,其突變與天使綜合征相關。在HPV感染中,被病毒蛋白E6招募以降解p53。

是重要的神經生物學和腫瘤學靶點,其配體可用于PROTAC。

Smurf 家族

Smurf1和Smurf2,主要調控TGF-β信號通路和細胞極性。

在調控發育和細胞信號通路方面有潛力,但其PROTAC應用仍在探索中。

Itch

調控免疫和炎癥信號,如通過泛素化調控轉錄因子。

是一個有前景的E3,可用于設計免疫相關疾病的PROTAC。

HACE1

一個腫瘤抑制因子,通過降解Rac1等蛋白來抑制腫瘤生長。

研究相對較少,但因其底物與癌癥相關而受到關注。

HUWE1

一個巨大的HECT型E3,降解多種底物,如Myc, p53, Mcl-1,在細胞命運決定中起核心作用。

由于其能降解多個關鍵致癌蛋白,是PROTAC開發中一個非常有吸引力的E3。

 

 RBR型 E3連接酶:在機制上混合了RING和HECT的特點。它們有RING結構域來結合E2,但其催化機制類似于HECT型,會形成一個共價的E3-泛素中間體。

 

E3連接酶/復合物

特點與功能

PROTAC中的應用

CRBN-DDB1

CRBN與DDB1等蛋白形成復合物,是沙利度胺及其衍生物(來那度胺、泊馬度胺)的直接靶點。

PROTAC兩大明星"E3之一絕大多數已進入臨床的PROTAC都招募CRBN。其配體來自免疫調節藥物,具有優異的藥物性質和廣泛的適用性。

Parkin

與帕金森病密切相關,參與線粒體自噬(清除受損的線粒體)。

其配體被用于設計靶向線粒體相關蛋白的PROTAC,是神經退行性疾病治療的研究熱點。

HOIP/HOIL-1/LUBAC

已知的催化線性泛素鏈生成的復合物,對NF-κB信號通路至關重要。

其獨特的線性泛素化功能正在被研究,以開發新型的PROTAC或調控工具。

HHARI

與Parkin結構相似,參與轉錄調控和細胞應激反應。

研究仍在早期階段,是拓展E3工具箱的潛在目標。

 

目前PROTAC研發嚴重依賴CRBN和VHL,這可能導致耐藥性和組織特異性受限。未來發展的一個關鍵方向就是開發新型E3連接酶的配體,以擴充PROTAC的“工具箱"。

 

貨號

產品名稱

UA080262

Biotinylated CRBN/DDB1 Protein

UA080011

DDB1/CRBN Complex, His Tag Protein

UA080473

CRBN/DDB1 Protein, Dog

UA080012

VHL/Elongin-C/Elongin-B Complex, His Tag Protein

UA080162

MDM2 Protein

UA085001

SKP1 His Tag Protein, Human

UA085002

SKP2 GST Tag Protein, Human

UA010573

XIAP(Bir3) His Tag Protein, Human

UA070026

UBE3A His&Flag Tag Protein, Human

 

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 三、熱門靶點深度解析:PROTAC的“用武之地"

 

  1.  STAT6

STAT6是信號轉導與轉錄激活因子家族的重要成員,主要由IL-4或IL-13激活。它作為轉錄因子,在調節免疫反應、細胞分化和增殖等過程中發揮關鍵作用。STAT6在多種疾病中扮演重要角色,如特應性皮炎、哮喘和某些癌癥。然而,STAT6功能缺失也可能導致免疫缺陷。

 

在STAT6靶點研究中,PROTAC技術展現出巨大潛力。通過降解STAT6,可從根源上解決相關疾病。例如,針對特應性皮炎的STAT6特異性PROTAC分子KT-621,已在臨床試驗中顯示出快速降解血液細胞中STAT6的能力。

 

貨號

產品名稱

UA085003

Human STAT6/CRBN PROTAC Binding Kit

UA080478

STAT6 His Tag Protein, Human

UA080455

STAT6 (K595R) His Tag Protein, Human

UA080456

STAT6 His-Strep Tag Protein, Human

UA080457

STAT6 GST Tag Protein, Human

 


  1.  IRAK4


IRAK4是先天免疫的關鍵介質,其過度激活與多種自身免疫疾病相關。IRAK4不僅具有激酶活性,還作為支架蛋白參與信號傳導。傳統的小分子抑制劑只能阻斷其激酶活性,無法干擾其支架功能,導致治療效果受限。

 

針對IRAK4靶點的PROTAC降解劑能夠同時阻斷IRAK4的激酶活性和支架功能,更有效地抑制炎癥信號通路。目前,全球已有多個IRAK4蛋白降解劑管線進入臨床研究階段,其中進展最快的是Kymera與賽諾菲合作開發的KT-474和國內藥企領泰生物自主研發的LT-002。這些降解劑在治療特應性皮炎和化膿性汗腺炎等疾病中展現出潛力。

 

貨號

產品名稱

UA080454

IRAK4 Protein, Human

UA080294

IRAK4 His Tag Protein, Human

 


  1. GSPT1

 

GSPT1是一種重要的翻譯終止因子,通過識別mRNA上的終止密碼子,促使翻譯完成的蛋白質從核糖體中分離出來。在腫瘤細胞中,GSPT1的表達水平往往異常,其下調可導致關鍵蛋白的異常表達,進而抑制腫瘤細胞增殖或誘導凋亡。因此,GSPT1成為腫瘤治療的潛在靶點。

 

GSPT1的降解可激活細胞的整合應激反應,導致細胞死亡。例如,GSPT1降解劑CC-90009在急性髓系白血病(AML)的臨床試驗中表現出良好的療效。此外,GSPT1降解還被發現可以破壞白血病轉錄網絡,降低關鍵融合蛋白及其相關轉錄因子的表達。

 

貨號

產品名稱

UA080159

GSPT1 GST tag Protein, Human

 

  1.  VAV1

VAV1是一種關鍵的信號轉導蛋白,主要在造血細胞(如T細胞、B細胞等)中表達。VAV1通過其GEF(鳥苷酸交換因子)功能激活Rac/Rho家族GTPases,參與細胞骨架重組、細胞遷移與粘附、受體聚集與信號傳導等過程。VAV1的異常表達或功能失調與多種疾病相關。在自身免疫和慢性炎癥疾病(如類風濕性關節炎、炎癥性腸病等)中,VAV1的異常激活可導致細胞因子過度分泌。在腫瘤中,VAV1的過表達與腫瘤的惡性程度、轉移和預后密切相關。

 

近年來,VAV1作為PROTAC靶點的研究取得了顯著進展。VAV1的降解可導致與免疫介導病癥相關的細胞因子顯著減少,因此在自身免疫和慢性炎癥性疾病中具有潛在的治療價值。例如,MRT-6160作為一種VAV1靶向的分子膠降解劑,在臨床前和早期臨床研究中表現出顯著的療效。

 

貨號

產品名稱

UA011223

VAV1 GST Tag Protein, Human

UA080427

VAV1 GST Tag Protein, Human

 

  1.  IKZF1 / IKZF3

IKZF1(Ikaros)和IKZF3(Aiolos)是Ikaros家族的轉錄因子,具有高度保守的鋅指結構,能調節淋巴細胞的分化、增殖。它們在多種免疫細胞中發揮關鍵作用,如在T細胞中調節白細胞介素2(IL-2)的表達。在腫瘤細胞中,IKZF1/IKZF3的異常表達與多種血液系統惡性腫瘤相關。

 

多個IKZF1/IKZF3靶向的PROTAC和分子膠降解劑已進入臨床研究階段。如CC-92480、CC-220(Iberdomide)和CC-99282等CELMoDs類化合物,在治療復發/難治性多發性骨髓瘤(RRMM)和非霍奇金淋巴瘤(R/R NHL)中顯示出良好的活性。此外,諾誠健華的ICP-490作為新型靶向蛋白降解劑,正在中國進行治療多發性骨髓瘤的臨床試驗。

 

貨號

產品名稱

UA080160

IKZF1 GST Tag Protein, Human

UA080161

IKZF3 GST Tag Protein, Human

 

四、總結

PROTAC技術通過利用人體天然的蛋白降解系統,為疾病治療開辟了全新的道路。隨著對E3連接酶生物學理解的加深和藥物化學技術的進步,針對STAT6、IRAK4等熱門及難治靶點的PROTAC藥物有望在未來十年內迎來爆發,真正實現從“不可成藥"到“可降解"的跨越。



優愛蛋白(UA Bio),重組蛋白專家

優愛蛋白專注于提供藥物研發、細胞治療、基因治療、基礎科研所需各種蛋白類試劑原材料和服務,包括藥物靶點蛋白、免疫檢查點蛋白、細胞因子、工具酶、 蛋白定制表達、全長跨膜蛋白開發等。優愛致力于為客戶提供優質的產品和專業服務,打造具有國際競爭力的高新技術企業。

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